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安徽医科大学第一附属医院前身为上海东南医学院附属东南医院，创办于1926年。经过80多年的发展，医院已成为国家卫生部三级甲等医院，全国卫生系统先进集体，卫生部临床药理基地，安徽省文明标兵单位，是安徽省规模最大的集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的综合性教学医院。

医院目前占地面积224.9亩，总建筑面积28万平方米。现有在职职工2100人，开放病床1890张，设临床科室39个，医技科室19个，临床教研室19个。有皮肤性病学、老年医学、内科学（含8个三级学科）、神经病学4个博士学位授予点和1个临床博士后科研流动站，硕士学位点覆盖所有的临床科室。

医院拥有一批高素质的专家队伍，其中博士生导师16人，副高职称以上专家555人，中级职称人员738人，博士和在读博士120余人，硕士270人，享受国务院和省政府特殊津贴114人，担任省级以上医学学术团体负责人60多人，有4人入选全国“百千万人才工程”，2人被卫生部授予“有突出贡献的中青年专家”，省厅以上跨世纪学术技术带头人、骨干教师107人，位居安徽省医疗机构第一。

医院坚持科教兴院战略，学科技术水平不断取得新的突破，受国家卫生部委托建立第一个中国人脑库，填补国内空白；银屑病的遗传学研究处于国际领先水平，盐裂皮肤免疫荧光技术诊断表皮下大疱病，国内领先。近四年，医院承担包括中国人银屑病易感基因研究、大别山隔离人群遗传资源调查等国家863计划和973计划、国家自然科学基金、安徽省自然科学基金等科研课题200余项，其中2004—2008年共获国家自然科学基金45项；获省部级以上奖项30余项，其中2007年获国家科技进步二等奖1项，教育部自然科学一等奖1项，2005、2006连续两年获中华医学科技一等奖，都填补了安徽省医疗行业获国家级奖项的空白。